Во все времена во всех без исключения культурах алхимия считалась наукой мистической и не допускающей дилетантства. Занятие это сложное, требующее предельной внимательности и четкого соблюдения тех немногих правил и ограничений, которые были выработаны годами. Перерождение предмета эксперимента, будь то одушевленный или неодушевленный, и его переход на новый уровень, должно происходить без нарушения законов, привитых еще с малых лет сыновьям Хоэнхайма их матерью. Во-первых, нельзя было нарушать природное равновесие, создавая из меньшего большее. Во-вторых, строжайше запрещено сотворять людей. Однако, выросшие без отца юноши, после смерти любимой мамы, решают воскресить ее, нарушив запрет. Самоуверенные Альфонс и Эдвард пренебрегли устоями за что и поплатились. В ходе преобразования один из них теряет душу, другой - конечности. Осознав свою ошибку и горько сожалея о содеянном, раскаявшиеся братья задумывают любой ценой вернуть всё назад. Ради этого Эд поступает служить в армию Аместриса на должность государственного алхимика. Здесь он планирует разгадать тайну обратного превращения и помочь своему единственному близкому и родному человеку.